Он занимал пост ректора КемГУ 27 лет (1978–2005) и в 1995 году вместе с В. С. Гершгориным открыл филиал в Новокузнецке.

Под его руководством 16 учеников защитили докторские диссертации, 39 — кандидатские. Его исследования в области химических реакций в твёрдой фазе взрывчатых веществ привели к созданию новых материалов для оборонной и космической отраслей. Захаров также возглавлял научную школу «Энергетические и наноразмерные вещества».

Память о Юрии Александровиче Захарове и его вкладе в науку будет жить в сердцах его учеников и коллег.